MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 475

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	TAG	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442242
2	NC_011730	AAT	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442242
3	NC_011730	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442242
4	NC_011730	TGT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442242
5	NC_011730	GTC	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442242
6	NC_011730	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442242
7	NC_011730	GAC	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442242
8	NC_011730	TGA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
9	NC_011730	C	6	6	976	981	0 %	0 %	0 %	100 %	218442243
10	NC_011730	CGT	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442243
11	NC_011730	GCC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442243
12	NC_011730	ACCA	2	8	1172	1179	50 %	0 %	0 %	50 %	218442243
13	NC_011730	TGA	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
14	NC_011730	GAT	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
15	NC_011730	TTC	2	6	1294	1299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442243
16	NC_011730	GTGA	2	8	1329	1336	25 %	25 %	50 %	0 %	218442243
17	NC_011730	GGA	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442243
18	NC_011730	TTA	2	6	1428	1433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442243
19	NC_011730	G	6	6	1511	1516	0 %	0 %	100 %	0 %	218442243
20	NC_011730	GCG	2	6	1557	1562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442243
21	NC_011730	TTC	2	6	1679	1684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442243
22	NC_011730	CGA	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442243
23	NC_011730	TTC	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442244
24	NC_011730	GAAA	2	8	1845	1852	75 %	0 %	25 %	0 %	218442244
25	NC_011730	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442244
26	NC_011730	T	6	6	2024	2029	0 %	100 %	0 %	0 %	218442244
27	NC_011730	T	7	7	2045	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	218442244
28	NC_011730	ACG	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442244
29	NC_011730	AGA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442244
30	NC_011730	TCGC	2	8	2260	2267	0 %	25 %	25 %	50 %	218442245
31	NC_011730	CGA	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442245
32	NC_011730	TAA	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442245
33	NC_011730	GTT	2	6	2325	2330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442245
34	NC_011730	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442245
35	NC_011730	TATT	2	8	2367	2374	25 %	75 %	0 %	0 %	218442246
36	NC_011730	GTT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
37	NC_011730	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442246
38	NC_011730	TGT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
39	NC_011730	ATT	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442246
40	NC_011730	TTC	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442246
41	NC_011730	T	6	6	2653	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	218442246
42	NC_011730	CTG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442246
43	NC_011730	AAT	2	6	2693	2698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442246
44	NC_011730	GAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442246
45	NC_011730	CTT	2	6	2724	2729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442246
46	NC_011730	TTAA	2	8	2774	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	218442246
47	NC_011730	A	6	6	2783	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	218442246
48	NC_011730	GTT	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
49	NC_011730	A	7	7	2857	2863	100 %	0 %	0 %	0 %	218442246
50	NC_011730	TAA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442246
51	NC_011730	ACT	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442246
52	NC_011730	TTG	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
53	NC_011730	GAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442247
54	NC_011730	ATG	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442247
55	NC_011730	T	7	7	3826	3832	0 %	100 %	0 %	0 %	218442247
56	NC_011730	TCT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442247
57	NC_011730	AGA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442247
58	NC_011730	TTA	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442247
59	NC_011730	C	6	6	3931	3936	0 %	0 %	0 %	100 %	218442247
60	NC_011730	TTCG	2	8	3995	4002	0 %	50 %	25 %	25 %	218442248
61	NC_011730	AATT	2	8	4006	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	218442248
62	NC_011730	C	6	6	4034	4039	0 %	0 %	0 %	100 %	218442248
63	NC_011730	TCA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442248
64	NC_011730	A	7	7	4130	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	218442248
65	NC_011730	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442248
66	NC_011730	CTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442248
67	NC_011730	ATT	2	6	4274	4279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442249
68	NC_011730	T	7	7	4306	4312	0 %	100 %	0 %	0 %	218442249
69	NC_011730	CAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442249
70	NC_011730	AT	3	6	4355	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	218442249
71	NC_011730	TAC	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442249
72	NC_011730	ATT	2	6	4400	4405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442249
73	NC_011730	T	7	7	4516	4522	0 %	100 %	0 %	0 %	218442249
74	NC_011730	CTG	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442249
75	NC_011730	T	6	6	4785	4790	0 %	100 %	0 %	0 %	218442250
76	NC_011730	TCTT	2	8	4867	4874	0 %	75 %	0 %	25 %	218442250
77	NC_011730	TTC	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442250
78	NC_011730	TCA	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442250
79	NC_011730	GCA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442250
80	NC_011730	ACC	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442250
81	NC_011730	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442250
82	NC_011730	GAA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442250
83	NC_011730	ATT	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
84	NC_011730	AAC	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
85	NC_011730	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
86	NC_011730	GCC	2	6	5630	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442251
87	NC_011730	A	7	7	5661	5667	100 %	0 %	0 %	0 %	218442251
88	NC_011730	T	6	6	5673	5678	0 %	100 %	0 %	0 %	218442251
89	NC_011730	ACCAA	2	10	5679	5688	60 %	0 %	0 %	40 %	218442251
90	NC_011730	A	7	7	5698	5704	100 %	0 %	0 %	0 %	218442251
91	NC_011730	CCA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442251
92	NC_011730	CGA	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
93	NC_011730	TCAA	2	8	5799	5806	50 %	25 %	0 %	25 %	218442251
94	NC_011730	AAC	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
95	NC_011730	TCAAA	2	10	5860	5869	60 %	20 %	0 %	20 %	218442251
96	NC_011730	TTA	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
97	NC_011730	GAT	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
98	NC_011730	T	6	6	5994	5999	0 %	100 %	0 %	0 %	218442251
99	NC_011730	GTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
100	NC_011730	AAAC	2	8	6074	6081	75 %	0 %	0 %	25 %	218442251
101	NC_011730	A	6	6	6107	6112	100 %	0 %	0 %	0 %	218442251
102	NC_011730	AG	3	6	6162	6167	50 %	0 %	50 %	0 %	218442251
103	NC_011730	AG	3	6	6308	6313	50 %	0 %	50 %	0 %	218442251
104	NC_011730	TAC	2	6	6369	6374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
105	NC_011730	GAAG	2	8	6391	6398	50 %	0 %	50 %	0 %	218442251
106	NC_011730	AAC	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
107	NC_011730	ATT	2	6	6461	6466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
108	NC_011730	ATT	2	6	6527	6532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
109	NC_011730	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	218442251
110	NC_011730	ACAA	2	8	6559	6566	75 %	0 %	0 %	25 %	218442251
111	NC_011730	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442251
112	NC_011730	GCG	2	6	6710	6715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442251
113	NC_011730	TCT	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442251
114	NC_011730	A	6	6	6775	6780	100 %	0 %	0 %	0 %	218442251
115	NC_011730	TAG	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
116	NC_011730	TCA	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
117	NC_011730	TAA	3	9	6874	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
118	NC_011730	AAC	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
119	NC_011730	CTC	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442251
120	NC_011730	CT	3	6	7009	7014	0 %	50 %	0 %	50 %	218442251
121	NC_011730	AGAA	2	8	7122	7129	75 %	0 %	25 %	0 %	218442251
122	NC_011730	CAC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442251
123	NC_011730	AATG	2	8	7252	7259	50 %	25 %	25 %	0 %	218442251
124	NC_011730	G	6	6	7353	7358	0 %	0 %	100 %	0 %	218442251
125	NC_011730	TAG	2	6	7393	7398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
126	NC_011730	TAC	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
127	NC_011730	ACAA	2	8	7497	7504	75 %	0 %	0 %	25 %	218442251
128	NC_011730	ATT	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
129	NC_011730	TAG	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
130	NC_011730	ATT	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
131	NC_011730	GCA	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
132	NC_011730	A	6	6	7925	7930	100 %	0 %	0 %	0 %	218442251
133	NC_011730	AGA	2	6	7936	7941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
134	NC_011730	ATC	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
135	NC_011730	CAT	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
136	NC_011730	CCT	2	6	8031	8036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442251
137	NC_011730	AG	3	6	8120	8125	50 %	0 %	50 %	0 %	218442251
138	NC_011730	CTT	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442251
139	NC_011730	TAAA	2	8	8133	8140	75 %	25 %	0 %	0 %	218442251
140	NC_011730	GAA	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
141	NC_011730	CAT	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
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172	NC_011730	CCTG	2	8	9285	9292	0 %	25 %	25 %	50 %	218442252
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261	NC_011730	GTGG	2	8	13469	13476	0 %	25 %	75 %	0 %	218442254
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265	NC_011730	AG	3	6	13547	13552	50 %	0 %	50 %	0 %	218442254
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268	NC_011730	AGAA	2	8	13622	13629	75 %	0 %	25 %	0 %	218442254
269	NC_011730	TATG	2	8	13657	13664	25 %	50 %	25 %	0 %	218442254
270	NC_011730	ATGG	2	8	13670	13677	25 %	25 %	50 %	0 %	218442254
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389	NC_011730	CAAAA	2	10	24748	24757	80 %	0 %	0 %	20 %	218442266
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